全长转录组测序分析

简介：

全长转录组测序是在长读长的高通量测序技术发展成熟之后兴起的一项测序服务，它是转录组测序服务的一种。它主要采用三代测序平台（Pacbio、Nanopore）对生物细胞、组织、器官或者个体中所有转录和表达的基因进行测序。全长转录组测序的超长读长可获得mRNA全长序列及完整结构信息。克服无参考基因组物种转录本拼接短、信息不完整的难题，实现有参考基因组物种研究可变剪切及融合基因等结构变异。

技术流程：

   全长转录组测序实验流程包括样品检测、文库构建和上机测序。实验流程见下图:

                           全长转录组实验流程图                                                                全长转录组分析流程图

分析内容：

  全长转录组分析的意义之于有参考基因组物种的意义在于可以校正现有的基因模型、发现新基因或者新的可变剪切形式以及进行融合基因分析；而对于无参考基因组物种，其主要意义在于可以构建较为完善的基因模型集，作为RNA-Seq定量分析的参考序列。有参或无参全长转录组分析内容见下表：

服务流程：

样品寄送 ⇒ 建库测序 ⇒ 数据分析 ⇒ 出具报告 ⇒ 售后答疑

样本要求：

RNA样品：样品浓度≥ 100 ng/uL；总量≥5ug；样本无 DNA 及杂质污染，无降解或轻微降解， 满足 2 次或 2 次以上建库用量

生物样品：样品新鲜采集、快速超低温冷冻、干冰寄送。详细步骤根据样品特点和检测目的在采集和送样前咨询相关工作人员。

合作客户：

到目前为止，全长转录组测序分析已经开展了全国范围内的客户服务。技术服务涉及的科研院所多达几十家，遍布全国十几个省市自治区，如清华大学、山东大学、浙江大学、浙江工业大学、协和医科大学、海南大学、内蒙古大学、中国科学院药用植物研究所、中科院微生物研究所、中科院生物物理研究所、中科院植物研究所等。